Το Πανεπιστήμιο Αιγαίου ιδρύθηκε το 1984 (ΠΔ 83/1984), με αναφορά στο σχέδιο του Κωνσταντίνου Καραθεοδωρή για το Ιωνικό Πανεπιστήμιο της Σμύρνης. Είναι το μόνο πολυνησιωτικό και το πιο γεωγραφικά εκτεταμένο πανεπιστήμιο της χώρας, με 18 Τμήματα σε 6 Σχολές σε 6 νησιά και διοικητική έδρα τη Μυτιλήνη. Αναπτύσσει νέα, συνήθως διεπιστημονικά, γνωστικά αντικείμενα και καλύπτει όλους τους Νομούς του Αιγαίου.